Biospéléologie,FFS Fédération Française de Spéléologie

La « biospéléologie » ou « biospéologie » est l'étude des organismes cavernicoles. Les spéléologues sont les premiers explorateurs du monde souterrain, ils participent activement à l'étude de la faune souterraine.

La faune souterraine terrestre (hors Chiroptères) est majoritairement constituée de petits invertébrés, souvent ne dépassant pas la taille de 2 cm.
Certains sont trogloxènes, ils sont présents sous terre par `accident` (comme, par exemple, des Coléoptères tels que les Lucanes qui peuvent parfois tomber au fond d'un puits).
D'autres sont troglophiles car ils côtoient le milieu souterrain par choix, mais peuvent aussi vivre en milieu extérieur. C'est le cas de la plupart d'entre eux, comme les Araignées Tégénaires ou encore certains Isopodes que l'on retrouve aussi bien dans les grottes que sous des pierres à l'extérieur.
D'autres, en revanche, sont troglobies, ils sont totalement inféodés au milieu souterrain (ou stygobies pour la faune aquatique). Ils sont plus rares et présentent des adaptations morphologiques particulières : dépigmentation, dégénérescence oculaire, aptérisme, hyper développement des appendices (soies, pattes, antennes). On retrouve par exemple certains Diplopodes ou Coléoptères comme les Aphaenops (Carabe troglobie endémique de la chaîne des Pyrénées). Ces animaux ne peuvent pas vivre en extérieur car ils n'ont plus aucune protection contre le rayonnement UV et ont besoin d'une humidité supérieure à 90%, sinon leurs téguments se dessèchent. Ils sont souvent beaucoup moins connus.

La faune aquatique souterraine ou stygofaune peut être très variée. Elle est encore assez mal connue. Les animaux totalement inféodés au milieu aquatique souterrain, sont dits stygobies (Styx = le fleuve des enfers). Cette faune, en France, est représentée par environ 60 % de crustacés, 20 % de Gastéropodes et 6 % de Planaires. Il existe environ 7000 espèces stygobies dans le monde et environ 400 en France, représentées par 100 genres.
Ces animaux ne sont pas toujours accessibles. On peut les rencontrer aux émergences d'eaux souterraines, notamment après une crue. On peut également les rencontrer au fond des puits d'eau ou pendant des explorations de rivières souterraines accessibles par l'homme.

Outre cette faune existe également un monde bactérien à l'origine de la chaîne trophique souterraine.
Souvent visible sous forme de biofilms accrochés aux parois, ce monde occupe également le sol et les eaux souterraines.
Son étude est en plein développement grâce aux progrès réalisés dans les études de l'ARN et de l'ADN. Les résultats retracent une histoire qui a commencé il y a plusieurs millions d'années.

Grâce à l'activité de sa commission scientifique et notamment le Groupe d'Etude de Biospéologie, la Fédération française de spéléologie joue un rôle prépondérant dans la connaissance et la préservation de la biodiversité du Monde souterrain et la défense de son environnement.

Apport des spéléologues à la biospéologie

Au sein de la Commission scientifique (CoSci) de la Fédération est constitué le Groupe d'Étude de Biospéologie (GEB). La biospéologie est une discipline scientifique consacrée à l'étude de l'ensemble des formes de vie du milieu souterrain, aquatique et terrestre. Elle couvre des champs variés, allant de la systématique et de la génétique à l'histoire évolutive, la biologie, l'écologie et l'analyse des interactions entre espèces.

Les biospéologues jouent un rôle essentiel dans la découverte, l'observation et la collecte d'organismes issus de milieux souterrains souvent difficiles d'accès pour les biologistes, pour des raisons techniques ou logistiques. Les données et échantillons recueillis sont ensuite exploités par des spécialistes afin de préciser la répartition géographique des espèces, de décrire de nouvelles espèces ou de nouveaux genres, et d'évaluer la biodiversité locale.

Certains biospéologues ont acquis une expertise et sont devenus des références dans leur domaine. Les membres du GEB participent aux opérations de comptage des chiroptères et assurent la gestion scientifique de certaines cavités, en particulier dans le Lot. Le GEB répond à des sollicitations institutionnelles émanant de parcs nationaux (Calanques), de parcs naturels régionaux (Chartreuse) et des Directions régionales de l'environnement, de l'aménagement et du logement (DREAL).

La Fédération Française du Tourisme et du Patrimoine Souterrain (FFTS) propose des actions de sensibilisation à la biospéologie à destination des guides, assurées par les membres du GEB. Le groupe est également impliqué dans des programmes de sciences participatives, tels que Stygofaune en Nouvelle-Aquitaine ou des projets de collecte de bactéries souterraines.

Les biospéologues du GEB interviennent dans le dispositif du Label Établissement scolaire (collège de Montbron, Charente), encadrent des étudiants de master en biodiversité et accueillent des volontaires en service civique. Ils proposent des conférences, participent à des colloques nationaux et internationaux, publient des travaux, et préparent un inventaire de la biodiversité souterraine de France prévu pour fin 2026. La FFS organise également chaque année des stages de formation à la biospéologie, ouverts à tous les publics intéressés.

Références

Ariagno D, Lips J, Lips B (2025). – Étude biospéologique - Inventaire de la faune souterraine du département du Rhône 2025. Étude effectuée par APEKAL (Association de Protection et d'Étude du Karst de l'Ain et Limitrophe). Association APEKAL – DREAL AURA. 298 p.

Fédération Française de Spéléologie (FFS)-Commission scientifique (CoSci)-Groupe d'Étude de Biospéologie (GEB) (2021). – Découverte de la vie en milieu souterrain en France. ISBN : 9782 74170 7066. Livret de 16 p.

Grenier J.-P., Lebreton B., Lips J., Brenguer M. (2019). – Étude biospéologique - Inventaire des invertébrés et diagnostic patrimonial de la biodiversité d'un réseau de cavités de Franche-Comté - Doubs, Jura, Haute-Saône et Territoire de Belfort. Étude effectuée par le GEB (Groupe d'Étude de Biospéologie) 2014-2018. Janvier 2019, 314 p.

Lips J., Lips B., Dodelin C., Lebreton B., Le Barz C. (2021). – Étude biospéologique. Inventaire de la faune souterraine de Chartreuse 2018-2021. 94 p.

Villegas J.-P., Lips J., Grenier J.-P., Motte D. (2023). – Inventaire biospéologique des invertébrés cavernicoles dans le réseau de RNR cavités à chiroptères. 95 p.